石河子大学自1989年开始招收审计学专科学生，从2001年开始，在会计学专业下招收审计学方向的本科生，2005年开始正式招收审计学专业本科学生，至今已近30年办学历史。20余年来，已累计为社会培养培养审计学本科人才超过1000余人、审计学专科人才近600余人。作为兵团“金牌”培训基地，每年为兵团财会、审计人员进行在职培训超过千人，为会计、审计在岗人员提供后续教育平台，有力推动了兵团会计、审计事业的发展。经过多年建设，石河子大学审计学科已成长为西北领先、全国知名的特色优势专业，在全国高校本科专业排名中位列前茅。
2018年，经国务院学位委员会授权批准，石河子大学开始招收全日制审计专业硕士（MAud），招生对象主要为全日制应届或历届本科生，采取全日制脱产教学，学制2年。承袭石河子大学审计学、会计学及工商管理一级学科博士点的平台优势，审计专业硕士点具有如下的特色：
师资队伍力量雄厚，学术梯队合理。本学科现有专任教师21名，其中教授9名，副教授7名，高级职称比例达到76%；具有博士学位的教师15名，博士比例达到71.4%；师资队伍中2人入选财政部“全国会计领军人才”；中青年教师居多且均具有（或在读）博士学位。同时，本科学还适时聘请富有经验的实务兼职教师，目前外聘实务兼职教师23名，均为疆内知名企业的骨干或高管。
专业积淀深厚，研究成果卓著。学科已经形成一批能够有力支撑学科发展、具有学术影响力的科研成果，近5年来，已在《经济研究》、《管理世界》、《会计研究》等权威期刊以及《审计研究》、《经济管理》、《审计与经济研究》等CSSCI来源期刊公开发表学术论文数十篇，出版专著9部；荣获省部级以上成果奖5项；先后承担省部级以上各类纵向科研项目40余项，其中，国家级科研项目5项，自治区及兵团社科基金等其他省部级项目19项。
教学科研平台日渐完善。本学科依托的会计学系现有会计学、审计学、财务管理3个本科专业，会计学和财务管理2个学术硕士点，MPAcc和资产评估（MV）2个专业学位点。依托学院国家重点（培育）学科、工商管理和应用经济学两个一级学科博士点、博士后科研流动站和工商管理、应用经济学等3个一级学科硕士点等学科支撑，以及国家级“经济与管理实验教学示范中心”、新疆高校人文社科重点研究基地等多个科研教学平台，审计学及其相关专业、学科及学历层次之间已经形成资源共享、协同推进的良好局面，审计学科建设水平已位居新疆第一、西部前茅，人才培养质量广受用人单位好评。
